DNA基础模型超越序列组成能力评估

2026年10月15日，一项被NeurIPS 2026（Evaluations & Datasets Track）接收的研究在arXiv发布，评估五个DNA基础模型的冻结表征与归一化k-mer频率的对比表现。研究使用57个基因组分类数据集和两项探索性基因表达回归任务。结果显示，简单k-mer特征与多数模型表现相当；NTv3表现出一致优势，在57个数据集中的46个上优于全局6-mer特征，平均ΔMCC为+0.072；Caduceus增益较小；其余模型的平均MCC未见提升。该研究由Vincenzo Yuto Civale等作者完成，结论指向DNA基础模型在序列组成之外所学有限。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。