PIDiff：面向蛋白质界面设计的离散与 SE(3) 联合扩散框架

PIDiff 是一个物理化学增强的多模态扩散框架，通过在离散序列空间与连续 SE(3) 结构流形上联合扩散，实现靶标条件化的蛋白质序列与结构共设计。其核心 PIFormer 架构交替使用几何感知的不变点注意力与全局序列自注意力，并基于从 PDB 构建的 PIBench 数据集预训练，再针对 minibinder 与抗体设计微调。